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6月27日，由清华大学主办、中国外交学会协办的第二届世界和平论坛在清华大学拉开帷幕。中国国家副主席李源潮出席论坛开幕式并以“同心求和平，携手促安全”为题发表致辞。清华大学校长陈吉宁主持开幕式。

6月25日上午，张光斗先生遗体送别仪式在八宝山革命公墓举行。张光斗先生的生前友好、各界人士以及清华师生千余人参加了送别仪式。

中国共产党的优秀党员，杰出的水利水电工程专家和工程教育家，我国水利水电事业的主要开拓者之一，中国科学院、中国工程院院士，清华大学原副校长张光斗同志，于2013年6月21日13时42分在北京逝世，享年101岁。

2013年清华大学计划招收本科生3372人，与去年持平。按照“优化生源结构，促进教育公平”的原则，在保持全国各省招生计划总量相对稳定的同时，重点将招生计划向高等教育欠发达且生源数量相对较多、升学压力较大的地区倾斜。

6月14日，清华柴继杰教授等在《科学》在线发表论文，首次报道了小鼠狈翱顿样受体狈尝搁颁4自抑制状态的晶体结构，并通过结构分析和生化实验揭示了该蛋白维持自抑制作用的分子机制，这也是狈翱顿样受体家族中首个被解析出的近乎全长的蛋白质晶体结构。